海军指挥学院是海军最高学府，主要担负培养海军中高级指挥干部、海军军以上机关参谋及军事学硕士、博士研究生的任务。
　　 学院的前身是刘伯承元帅任院长的中国人民解放军军事学院海军系，创立于1952年5月16日。1957年10月8日，海军系扩建为海军军事学院。1960年10月1日，学院改称为海军学院。1973年，中央军委决定在原海军学院院址组建海军军政干部学校。1978年1月，海军军政干部学校恢复为海军学院。1986年6月9日，改称海军指挥学院至今。 学院设有战役指挥系、战术指挥系、政治指挥系、后勤指挥系、研究生管理大队、战役训练班。
　　 目前设置并获得授权点的专业有：军事思想、军事历史、海军战略学、海军战役学、海军合同战术学、海军作战指挥和海军后勤组织指挥。其中海军战役学、海军合同战术学是全军重点建设学科。